Bước 1: Nộp hồ sơ Tổ chức, cá nhân đăng ký cấp lại Giấy chứng nhận an toàn sinh học nộp hồ sơ trực tiếp hoặc qua đường bưu điện tới Văn phòng tiếp nhận và trả kết quả giải quyết thủ tục hành chính của Bộ Nông nghiệp và Môi trường, số 10 đường Tôn Thất Thuyết, phường Mỹ Đình 2, quận Nam Từ Liêm, Thành phố Hà Nội. Hoặc nộp trực tuyến tại địa chỉ https://dichvucong.mae.gov.vn. Bước 2: Kiểm tra, xem xét cấp lại Giấy chứng nhận an toàn sinh học Bộ Nông nghiệp và Môi trường có trách nhiệm kiểm tra, xem xét cấp lại Giấy chứng nhận an toàn sinh học. Trường hợp từ chối cấp lại phải thông báo bằng văn bản và nêu rõ lý do.